亚太科技大学的研究生学院提供给学生们寻求提高自身的职位和深造的好机会，研究生学院提供了工商管理硕士，软件工程硕士等多种专业课程。亚太科技大学硕士课程开设英国硕士学位课程、亚太科技大学硕士学位课程以及双硕士学位课程，英国硕士学位课程由英国斯塔福德郡大学授予硕士学位，亚太科技大学硕士学位课程由亚太科技大学授予硕士学位，而双硕士学位课程则是由英国斯塔福德郡大学与亚太科技大学共同授予硕士学位。
英国硕士学位课程(英国斯塔福德郡大学授予硕士学位证）
亚太科技大学硕士学位课程
双硕士文凭学位课程(马来西亚亚太科技大学及英国斯塔福德郡大学同时授予硕士学位证）
